Kruizų skyrius pradėjo savo veiklą 2006 m. kovo 1d.

Kruizų skyriaus pagrindinės funkcijos:

- KVJUD, Klaipėdos m. savivaldybės bei kitų organizacijų veiksmų derinimas. Aktyvus bendradarbiavimas su savivaldybės institucijomis;

- Visų kruizinius laivus ir turistus aptarnaujančių įmonių, organizacijų veiklos koordinavimas;

- Kruizinio turizmo plėtros Klaipėdoje strategijos rengimas. Kruizinių laivų rinkos plėtojimas;

- Vieningas marketingo strategijos kūrimas (leidiniai, straipsniai, parodos ir t.t.). Rinkodarinės veiklos, siekiant pritraukti į Klaipėdą kruizinius operatorius, koordinavimas.

- Pasiūlymų įstatyminės bazės gerinimui rengimas. Vizų klausimų ir kitų formalumų supaprastinimo sprendimų siūlymas;

- Dalyvavimas tarptautinių organizacijų veikloje;

- Dalyvavimas projektuose;

- Statistikos apie Kruizinę laivybą rinkimas ir analizė;

- Ryšiai su visuomenė ir informacijos teikimas;

- Renginių organizavimas Kruizinių laivų terminale.